螢光檢測的原理是透過儀器射出特定波長的光束，用以激發水中浮游植物產生螢光。當浮游植物受激發後回到基態，便將多餘的能量以光子形態釋出來，形成螢光。螢光資料經過葉綠素甲濃度校正，可以推估海洋中浮游植物數量，是研究海洋生地化的重要參數之一。

實驗檢測流程
　　將Seabird SBE-911 PLUS溫鹽深儀(Conductivity Temperature Depth，CTD)投放至水深150 m處（水深不足的測站則以實際海底深度少10 m為原則），取得海水溫度、鹽度及對應水深之連續資料。